Alamut Kalesi, tarihi boyunca pek çok medeniyete ev sahipliği yapmış ve stratejik önemiyle dikkat çekmiştir. 13. yüzyılda yaşanan Moğol fetihleri, bu kalenin kaderini de değiştirmiştir. Moğolların bölgedeki etkisi, sadece askeri zaferlerle sınırlı kalmamış, aynı zamanda kültürel ve sosyal yapıları da derinden etkilemiştir. Bu olay, Orta Doğu tarihinin seyrini değiştiren önemli bir dönüm noktasıdır.

Alamut Kalesi, 1256 yılında Moğol hükümdarı Hülagu tarafından ele geçirilmiştir. Bu olay, Moğolların Nizari İsmaili devletini yıkmadan batı Asya'da genişlemesini ve İslam devletlerinin topraklarını istila etmesini mümkün kılmıştır. Alamut'un son komutanı olan Rükneddin Hür Şah, teslim olmuş, ancak daha sonra öldürülmüştür. Moğol ordusu, kaleyi ele geçirdikten sonra tahrip etmiş ve içinde bulunan ünlü kütüphaneyi yakmıştır.