559 numaralı otobüs, Türkiye'nin çeşitli şehirlerinde farklı rotalar izleyerek yolcu taşımaktadır. Bu otobüs, her şehirde belirli duraklar arasında seferler düzenleyerek ulaşım ihtiyacını karşılamaktadır. İstanbul, Ankara ve İzmir gibi büyük şehirlerdeki güzergahları, yolcuların ihtiyaçlarına göre düzenlenmiştir.

559 numaralı otobüsün tam güzergahı, farklı şehirler için değişiklik göstermektedir:

• İstanbul: 559 numaralı otobüs, "Gaziosman Paşa Caddesi‎→Fatih Tren İstasyonu 1" güzergahında çalışmaktadır.
• Ankara: 559 numaralı otobüs, "Koru Metro İstasyonu-Beyler Cd.-Orhan Gazi Blv." güzergahını takip etmektedir.
• Bayraklı-Bornova (İzmir): 559 numaralı otobüs, "Cengizhan Son Durak – Evka 3 Aktarma Merkezi" güzergahında çalışmaktadır.