Akdamar Adası'nda yer alan kilise, hem tarihi hem de mimari açıdan büyük bir öneme sahiptir. Ermeni mimarisinin önemli bir örneği olan bu yapı, farklı dönemlerin etkilerini taşıyan özgün detaylarıyla dikkat çekmektedir. Yapının dış yüzeyindeki zengin kabartmalar ve iç mekanındaki mimari unsurlar, ziyaretçileri derin bir tarih yolculuğuna çıkarmaktadır.

Akdamar Adası'ndaki kilise, merkezi kubbeli, dört yapraklı yonca biçiminde haç plana sahiptir. Mimari özellikleri:

• Malzeme: Kesme taş.
• Dış cephe: İncil ve Tevrat'tan alınma sahneler, dini figürler, Ermeni asiller, saray yaşantısı, av sahneleri ve hayvan motifleriyle işlenmiş figürlü taş kabartmalarla süslenmiştir.
• Plan: Batı ve güneyden girilen kilise, doğu-batı doğrultusunda dikdörtgen bir alana oturur.
• Destek: Merkezi kubbe, batıdaki iki serbest ayak ve doğudaki apsis duvarına dayanan kemerlerle taşınır.
• Apsis: Doğudaki apsis beş köşelidir ve iki yanındaki hücrelerle çevrilidir.
• Batı haç kolu: Kaburgalı kubbe ile örtülmüştür.
• Ek yapılar: Kuzeydoğusundaki şapel 1296-1336, batısındaki jamatun 1763, güneyindeki çan kulesi ise 18. yüzyıl sonlarında ilave edilmiştir.

Akdamar Kilisesi, 2005-2006 yıllarında yapılan restorasyonla 2007 yılında anıt müze olarak ziyarete açılmıştır.