Akçakese, tarihi derinlikleriyle dikkat çeken bir yerleşim alanıdır. Anadolu'nun zengin kültürel ve tarihi mirasına ev sahipliği yapan bu köy, geçmişten günümüze birçok medeniyete tanıklık etmiştir. 1100'lerin başlarına kadar uzanan köklü geçmişi, köyün adının ilk kez 1463 yılında kaydedilmesiyle taçlanmıştır. Akçakese, tarih boyunca farklı isimlerle anılsa da, her dönem kendi kimliğini ve karakterini barındırmıştır.

Akçakese'nin tarihi hakkında şu bilgiler mevcuttur:

• Kuruluş Dönemi: Akçakese'nin kuruluş dönemi, Anadolu'daki ilk beylikler dönemine (1100'lerin başı) dayanmaktadır.
• Yazılı Kaynaklarda İlk Görünüm: Köyün adı, ilk olarak 1463 yılında yazılan Tahrir Defteri'nde "Akçakilise" olarak geçmiştir.
• Türk Dönemi: 1071 Malazgirt Zaferi'nden sonra Anadolu'ya giren Türkmen boyları, yerleştikleri yerlere ya boy veya oymak adlarını ya da Bizans'tan kalma isimleri vermişlerdir. Akçakese de bu köylerden biridir ve adının "Akça-kilise"den geldiği düşünülmektedir.
• Osmanlı Dönemi: 1530 tarihli Muhasebe-i Vilayet-i Anadolu Defteri'nde de köy "Akçakilise" olarak anılmıştır. 1830 yılında ise köyde 59 hane olduğu kaydedilmiştir.
• Modern Dönem: Türkiye Cumhuriyeti'nin kurulmasıyla köy varlığını sürdürmüş, Güdül Ayaş'a bağlı bir kasaba iken gelişimiyle birlikte ilçe yapılmış ve Akçakese, Güdül'e bağlanmıştır.

Köy ve çevresinde, Türk dönemi öncesine ait Paflagonya, Roma ve Bizans dönemine ait tarihi eserler de bulunmaktadır.